一般細菌系泌尿道感染
目前主要以抗生素治療為主，若您的泌尿道感染合併有發燒或血尿的情況，建議請您務必尋求泌尿科醫師的診治，以確定是否有合併其他泌尿系統的病症。

淋菌性尿道炎的治療
早期淋病的治療是施以盤尼西林注射、使用口服或注射頭孢子黴素或使用奎諾隆類藥物。近年來，亞洲地區（包括台灣）奈瑟氏淋病雙球菌已逐漸對盤尼西林和奎諾隆類藥物產生抗藥性，頭孢子黴素藥物（尤其是第三代頭孢子黴素）已經成為治療淋病的主要藥物。

非淋菌性尿道炎的治療
治療主要是新型紅黴素Azithromycin等。對紅黴素過敏者可以使用其他替代藥物。

生殖器疱疹的治療
目前沒有任何治療方式能完全根治，但抗病毒療法可於用藥期間縮短病程並預防發作；此外，對於有症狀的疱疹，長抑制性治療法能降低傳染給性伴侶的機會。

尖圭濕疣的治療
菜花的治療因醫師的經驗、醫療資源及病患的選擇而異，可用藥物治療、手術、電燒、冷凍及雷射療法；因為很難確定哪一種療法是優於另一種治療，所以選擇療法要考量病患之情況、可用之藥物、醫材及醫師的經驗。
目前要決定哪一種療法才能減低傳播能力仍是有困難的，許多病患需要的治療並非單一次即可，而是需要一系列或週期療程。假使連續同一療法經三次治療沒有進步，或是經過六次治療，菜花仍未完全乾淨，就要改變其他治療的方式或藥物了，而且要評估治療的療效，避免副作用過度治療。目前可由醫師處方，患者自行於患處擦拭的藥物。